存货在发生盘亏或者毁损时要注意增值税进项税额的转出，因非正常原因导致的存货盘亏或毁损，按规定不能抵扣的增值税进项税额应当予以转出；自然灾害造成外购存货的毁损，其进项税额可以抵扣不需要转出。

二、存货期末计价：是指企业在会计期末(通常指年末)编制资产负债表时，存货按何种价值列示。存货在期末的计价方法一般有三种，即成本法、市价法、成本与市价孰低法。 1、成本法，是指按照期末结存存货的实际采购成本或制造成本在资产负债表上列示。这种方法的优点是简便易行，并保证会计信息的可靠性：缺点是当存货市价下跌时，会导致资产虚增，不符合会计的谨慎原则。
2、市价法，是指按照期末结存存货的市场价格在资产负债表上列示。这种方法的优点是可以反映存货的实际价值，有助于提高会计信息的有用性；缺点是收集市价资料的工作量过大，不便于实际操作，当存货市价升高时，还会导致当期利润虚增。
3、成本与市价孰低法，是指在会计期末通过比较存货的成本与市价，取两者中较低的一个作为存货计价基础，即当存货成本低于市价时，按成本计价；当市价低于成本时，按市价计价。这里的成本指的是存货购入或生产时的实际成本，即存货的账面价值。与成本相比较的市价，并不是一般意义上的市场销售价格，它在不同国家有不同的规定，一般多采用重置成本和可变现净值。其中，重置成本是指在现有条件下重新购买相同存货而应支付的全部费用，可变现净值是指在企业日常的生产经营活动中，以存货估计售价减去至完工时估计将要发生的成本、估计的销售费用以及相关税费后的金额。我国《企业会计准则第1号——存货》规定，在资产负债表日，存货应当按照成本与可变现净值孰低计价。

存货在发生盘亏或者毁损时要注意增值税进项税额的转出，因非正常原因导致的存货盘亏或毁损，按规定不能抵扣的增值税进项税额应当予以转出；自然灾害造成外购存货的毁损，其进项税额可以抵扣不需要转出。